2. テーブルデータの限界 4.39GBのデータを read.table() webから取得した シロイヌナズナの 遺伝子発現データ 堅気の人はまず見る事が無いエラーメッセージ 3. データをどう管理するか RDBMS - リレーショナルデータベースマネージメントシステム - データを関係モデルで管理 - MySQL, PostgreSQL, Oracle, SQLite等 テーブル2 テーブル3 テーブル1 4. データをどう管理するか NoSQL 最近注目されているRDBMSと異なる技術 キー・バリュー型 ： データを単純に“キー”と“値”を持つものとして管理 - Cassandra（前までfacebookが使ってた）, Google BigTable, Amazon DynamoDB等 keyX 124 keyX 526 keyX 9579 keyY ABAV keyY DHHD k
下記のようなシステムでパフォーマンスが良さげな SQLite を使用予定ですが、もっと速いものが無いか確認のため他のデータベースのパフォーマンスを計測してみました。SQL 利用前提ですが、NoSQL が圧倒的な性能を出す場合は検討する必要があるので KVS も確認しました。 データ件数は 1 億件程度、JDBC SQL 利用可能 INSERT、UPDATE はバッチ SELECT は主キーアクセス性能を重視 将来スケールアウトのための分散はありえるが、スタンドアロンで遅いのはだめ データベースのパフォーマンス比較 計測したデータベース データベース名 タイプ 形態 評判 計測についての備考 SQLite RDB 組み込み ※2 おもちゃ、Android標準 JDBC操作 ※1 H2 RDB 組み込み ※2 組み込み最速 JDBC操作 ※1 Derby RDB 組み込み ※2 Java標準で
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