Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
THRB
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1BSX , 1N46 , 1NAX , 1NQ0 , 1NQ1 , 1NQ2 , 1NUO , 1Q4X , 1R6G , 1XZX , 1Y0X , 2J4A , 2NLL , 2PIN , 3D57 , 3GWS , 3IMY , 3JZC , 4ZO1
Ідентифікатори
Символи
THRB , C-ERBA-2, C-ERBA-BETA, ERBA2, GRTH, NR1A2, PRTH, THR1, THRB1, THRB2, thyroid hormone receptor beta, TRbeta
Зовнішні ІД
OMIM : 190160 MGI: 98743 HomoloGene: 36025 GeneCards: THRB
Пов'язані генетичні захворювання
selective pituitary resistance to thyroid hormone , generalized resistance to thyroid hormone [ 1]
Реагує на сполуку
DL-3,3',5'-triiodothyronine , tiratricol , трийодтиронін , левотироксин [ 2]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • chromatin DNA binding • thyroid hormone binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of heart contraction • female courtship behavior • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • слух • type I pneumocyte differentiation • negative regulation of female receptivity • animal organ morphogenesis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • negative regulation of eye photoreceptor cell development • retinal cone cell development • retinal cone cell apoptotic process • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • thyroid gland development • response to lipid • thyroid hormone mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 24.12 – 24.5 Mb
Хр. 14: 4.43 – 4.81 Mb
PubMed search
[ 3]
[ 4] Вікідані
THRB (англ. Thyroid hormone receptor beta ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [ 5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот , а молекулярна маса — 52 788[ 6] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTPNSMTENG LTAWDKPKHC PDREHDWKLV GMSEACLHRK SHSERRSTLK
NEQSSPHLIQ TTWTSSIFHL DHDDVNDQSV SSAQTFQTEE KKCKGYIPSY
LDKDELCVVC GDKATGYHYR CITCEGCKGF FRRTIQKNLH PSYSCKYEGK
CVIDKVTRNQ CQECRFKKCI YVGMATDLVL DDSKRLAKRK LIEENREKRR
REELQKSIGH KPEPTDEEWE LIKTVTEAHV ATNAQGSHWK QKRKFLPEDI
GQAPIVNAPE GGKVDLEAFS HFTKIITPAI TRVVDFAKKL PMFCELPCED
QIILLKGCCM EIMSLRAAVR YDPESETLTL NGEMAVTRGQ LKNGGLGVVS
DAIFDLGMSL SSFNLDDTEV ALLQAVLLMS SDRPGLACVE RIEKYQDSFL
LAFEHYINYR KHHVTHFWPK LLMKVTDLRM IGACHASRFL HMKVECPTEL
FPPLFLEVFE D
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Sakurai A., Nakai A., Degroot L.J. (1990). Structural analysis of human thyroid hormone receptor beta gene. Mol. Cell. Endocrinol . 71 : 83—91. PMID 1973914 DOI :10.1016/0303-7207(90)90245-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Frankton S., Harvey C.B., Gleason L.M., Fadel A., Williams G.R. (2004). Multiple messenger ribonucleic acid variants regulate cell-specific expression of human thyroid hormone receptor beta1. Mol. Endocrinol . 18 : 1631—1642. PMID 15105435 DOI :10.1210/me.2003-0346
Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator . Mol. Cell. Biol . 22 : 3358—3372. PMID 11971969 DOI :10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002
Rastinejad F., Perlmann T., Evans R.M., Sigler P.B. (1995). Structural determinants of nuclear receptor assembly on DNA direct repeats. Nature . 375 : 203—211. PMID 7746322 DOI :10.1038/375203a0
Parrilla R., Mixson A.J., McPherson J.A., McClaskey J.H., Weintraub B.D. (1991). Characterization of seven novel mutations of the c-erbA beta gene in unrelated kindreds with generalized thyroid hormone resistance. Evidence for two 'hot spot' regions of the ligand binding domain . J. Clin. Invest . 88 : 2123—2130. PMID 1661299 DOI :10.1172/JCI115542
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші