Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
OSR1
Ідентифікатори
Символи
OSR1 , ODD, odd-skipped related transcription factor 1, odd-skipped related transciption factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 608891 MGI: 1344424 HomoloGene: 8035 GeneCards: OSR1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • гіалоплазма • extrinsic component of membrane
Біологічний процес
• pronephros development • cellular response to retinoic acid • metanephric glomerulus vasculature development • roof of mouth development • диференціація клітин • specification of posterior mesonephric tubule identity • ureteric bud development • specification of anterior mesonephric tubule identity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • negative regulation of nephron tubule epithelial cell differentiation • positive regulation of gastrulation • embryonic skeletal joint development • metanephric cap mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development • positive regulation of bone mineralization • positive regulation of epithelial cell proliferation • embryonic skeletal limb joint morphogenesis • metanephric mesenchymal cell differentiation • posterior mesonephric tubule development • intermediate mesoderm development • embryonic digit morphogenesis • metanephric epithelium development • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • mesonephric duct morphogenesis • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • odontogenesis • mesonephros development • cell proliferation involved in kidney development • heart development • metanephric nephron tubule development • ureter urothelium development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • mesangial cell development • pattern specification involved in metanephros development • metanephric smooth muscle tissue development • renal vesicle progenitor cell differentiation • middle ear morphogenesis • embryonic skeletal joint morphogenesis • urogenital system development • metanephric mesenchyme morphogenesis • metanephros development • negative regulation of epithelial cell differentiation • metanephric interstitial fibroblast development • gonad development • embryonic forelimb morphogenesis • metanephric mesenchyme development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic hindlimb morphogenesis • osmosensory signaling pathway • peptidyl-threonine phosphorylation • negative regulation of creatine transmembrane transporter activity • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 19.35 – 19.36 Mb
Хр. 12: 9.62 – 9.63 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
OSR1 (англ. Odd-skipped related transciption factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот , а молекулярна маса — 29 611[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGSKTLPAPV PIHPSLQLTN YSFLQAVNGL PTVPSDHLPN LYGFSALHAV
HLHQWTLGYP AMHLPRSSFS KVPGTVSSLV DARFQLPAFP WFPHVIQPKP
EITAGGSVPA LKTKPRFDFA NLALAATQED PAKLGRGEGP GSPAGGLGAL
LDVTKLSPEK KPTRGRLPSK TKKEFVCKFC GRHFTKSYNL LIHERTHTDE
RPYTCDICHK AFRRQDHLRD HRYIHSKEKP FKCQECGKGF CQSRTLAVHK
TLHSQVKELK TSKIKC
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Katoh M. (2002). Molecular cloning and characterization of OSR1 on human chromosome 2p24. Int. J. Mol. Med . 10 : 221—225. PMID 12119563
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші