日本前内阁参事官、嘉悦大学教授高桥洋一在周刊富士发文指，中方快艇在台湾离岛金门周边海域翻船后，中共海警船开始巡逻，加强对台威吓，日本应重新检视最佳国防计划，思考如何因应。
高桥认为，中共党魁习近平把「统一台湾」当成第3任的目标且绝对要达标，而台湾下任总统赖清德选举期间提出的政见是「维持现状」，大陆要求「改变现状」，台湾希望「维持现状」，这之间有很大落差，通过对话来填补落差的可能性很小，一旦以武力解决，台湾有事就是日本有事，而当台湾的事变成亚洲的问题时，日本就得站在最前面。
高桥呼吁日本，现在情况不同于以往，应该思考调整「非核三原则」、实施核武共有并研究加入澳英美三方安全伙伴关系。
就在日本学者关注金门风波并建议调整日本国防策略之际，台湾与中共围绕快艇事件的协商似乎出现波折。据自由时报报导，双方3日上午在金门进行第15场闭门会谈，结束后，台湾方面的代表没有透露是否达成共识，并很快全数撤离金门，会场被退租。中共代表的签证可停留3天，他们因此继续呆在金门，等台湾官员的回复。
在台湾内部，立法院内政委员会预计4日针对事件进行专案报告。目前围绕事故定调，僵持不下。内政会召委高金素梅坚持在报告中使用「金门撞船案」这个名称，但海巡署不接受这个说法，认为海巡署是依法执法，捍卫主权，报告应该取名「『取缔大陆籍快艇事故案』专案报告」。
民进党立委林俊宪认为，使用「撞船案」这个书佛，是在呼应中共论调。林俊宪在脸书发文写道，「明有人可能好奇，两个字有差别这么大吗？很抱歉，真的有。因为...将焦点放在『撞船』而不是定调为执法事故，等于官方定调中国的主张是正确的...双方经过15轮谈判依然无法取得共识，最大分歧点在哪？就是针对事故的定调。中方坚持要我国承认是『恶意碰撞』，用意就是完全否定海巡执法的主权尊严，一旦接受，中国后续宣传一定是从『非法碰撞』否定台湾执法的权力，这么显而易见的陷阱，政府绝不可能去踩。」