Proteinski dimer

Dijagram dimera Ešerihija kolijeve galaktoze-1-fosfat uridililtransferaze (GALT) u kompleksu sa UDP-galaktozom. Joni kalijuma, cinka, i gvožđa su vidljivi kao ljubičasto, sivo, bronzano-obojene sfere.

U biohemiji, dimer je makromolekularni kompleks formiran od dva, obično ne-kovalentno vezana, makromolekula kao što su proteini ili nukleinske kiseline. Dimer je kvaternarna struktura proteina.^[1]

Homodimer se formira od dva identična molekula (procesom homodimerizacije). Heterodimer se formira od dva različita makromolekula (procesom heterodimerizacije).

Većina dimera u biohemiji nije vezana kovalentnim vezama izuzev disulfidnih veza. Primer takvih enzima je reverzibilna transkriptaza, kaja se sastoji od dva različita aminokiselinska lanca.^[2]

Neki proteini sadrže specijalizovane domene koji omogućuju dimerizaciju (dimerizacioni domeni).

Primeri

Antitela
- Receptori tirozinske kinaze
Transkripcioni faktori
- Leucinski rajsferšlus motiv proteina
- Nuklearni receptori
14-3-3 proteini
G protein spregnuti receptori
G protein βγ-podjedinica
Kinezin
Triosefosfateizomeraza (TIM)
Alkoholna dehidrogenaza
Faktor XI
Faktor XIII
Tol-slični receptor
Fibrinogen

Vidi još

Reference

^ Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
^ Nicolas Sluis-Cremer; Noureddine Hamamouch; Ana San Félix; Sonsoles Velázquez; Jan Balzarini & María-José Camarasa (2006). „Structure-Activity Relationships of [2‘,5‘-Bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-ß-d-ribofuranosyl]- 3‘-spiro-5‘ ‘-(4‘ ‘-amino-1‘ ‘,2‘ ‘-oxathiole-2‘ ‘,2‘ ‘-dioxide)thymine Derivatives as Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase Dimerization”. J. Med. Chem. 49 (16): 4834—4841. PMID 16884295. doi:10.1021/jm0604575.

Literatura

[Branden_ProteinStructure2nd-1] Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.

[2] Nicolas Sluis-Cremer; Noureddine Hamamouch; Ana San Félix; Sonsoles Velázquez; Jan Balzarini & María-José Camarasa (2006). „Structure-Activity Relationships of [2‘,5‘-Bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-ß-d-ribofuranosyl]- 3‘-spiro-5‘ ‘-(4‘ ‘-amino-1‘ ‘,2‘ ‘-oxathiole-2‘ ‘,2‘ ‘-dioxide)thymine Derivatives as Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase Dimerization”. J. Med. Chem. 49 (16): 4834—4841. PMID 16884295. doi:10.1021/jm0604575.

[1]

[2]