Даниэль Гарнеро дебютировал в «Индепендьенте» в 1991 году. Он был частью команды, пережившей в середине 1990-х годов всплеск удачных результатов после шести лет без титулов. В 1994 году Гарнеро вместе с «Инде» выиграл чемпионат Аргентины — Клаусуру. В том же году помог команде выиграть международный трофей — Суперкубок Либертадорес, который на тот момент был вторым по значимости турниром в Южной Америке[2]. В следующем году «короли кубков» выиграли Рекопу, обыграв победителя Кубка Либертадорес 1994 «Велес Сарсфилд»[3]. В том же году «красные дьяволы» во второй раз подряд выиграли Суперкубок Либертадорес[4].
В 1996 году Дани выступал в Чили за «Универсидад Католику», после чего вернулся в «Индепендьенте». В 2000 году полузащитник вновь отправился за рубеж, проведя Летний чемпионат Мексики в составе «Торос Несы»[5]. Последние два сезона игровой карьеры Даниэль Гарнеро провёл в родном «Индепендьенте»[6].
Уже в 2002 году Гарнеро вошёл в тренерский штаб «Арсенала» из Саранди, где работал до 2005 года. Последующие два сезона работал тренером в «Эстудиантесе» и «Индепендьенте». В 2008 году впервые возглавил клуб в качестве главного тренера — этой командой стал «Арсенал», с которым Гарнеро в первом же матче выиграл первый розыгрыш Кубка банка Суруга. В мае 2010 года возглавил «Индепендьенте»[6]. Как рассказал сам Гарнеро в интервью в 2017 году, краткосрочный период пребывания в «Инде» в 2010 стал худшим в его тренерской карьере: «Я был в центре спора между фанатами, которые не желали ухода Толо Гальего, и советом директоров, который хотел, чтобы он ушёл. И тут появился я, а результата с самого начала не было»[7].
С 2011 по 2015 год Даниэль Гарнеро дважды возглавлял «Сан-Мартин» из Сан-Хуана, а также работал в «Банфилде» и «Индепендьенте Ривадавия»[7]. С 2015 года работает в Парагвае. Один сезон отработал в «Соль де Америке», а в 2016 году возглавил «Гуарани». Добился с «аборигенами» лучшего результата в тренерской карьере, приведя команду к титулу чемпионов Парагвая в Клаусуре 2016[7].
28 декабря 2017 года Даниэль Гарнеро был представлен в качестве нового главного тренера асунсьонской «Олимпии»[8]. Привёл «деканов» к четырём подряд победам в чемпионате Парагвая[9].
