בתחילת שנת 2013 הונג ג'ן יִי, מפתח סביבת שולחן העבודה LXDE, לא היה מרוצה מהפיתוח שהיה קיים אז עם GTK3, והחל להתנסות בפיתוח חלופי לסביבת שולחן העבודה עם Qt במקום, כשהחל עם גרסת Qt למנהל הקבצים של LXDE, הקרוי PCManFM. עם זאת, הוא הבהיר גם שגרסאות GTK ו־Qt יתקיימו האחת לצד השנייה[1]. בהמשך נוצר היסב גם לממשק המשתמש הגרפי-lxrandr[2].
ב־3 ביולי באותה שנה הסב ג'ן יי את סביבת שולחן העבודה במלואה ל־Qt, היסב אשר נקרא LXDE-Qt[3]. אך ב־21 ביולי פוצל LXDE-Qt לשני מיזמים שונים: LXDE-Qt ו־Razor Qt, כשהעבודה על גרסת GTK נמשכה, מתוך שאיפה לאחד בעתיד בין שתי גרסאות Qt[4]. בהמשך נזנחה גרסת GTK לטובת גרסת Qt משופרת המורכבת שוב מאיחוד של שני המיזמים שפוצלו - שכעת כונתה LXQt. הגרסה הראשונה שפורסמה בשם זה הייתה 0.7.0[5].
ההפצהלובונטו החלה להשתמש בסביבת שולחן עבודה זו באופן רשמי החל מגרסה 18.10[7]. הפצות נוספות הכוללות גרסה רשמית של סביבת שולחן העבודה הן פדורה[8], דביאן[9], מנג'רו (בגרסה הנתמכת על ידי קהילת המפתחים) ואופן סוזה.