Milan Fretin obtient ses premiers succès notables sur piste chez les juniors (moins de 19 ans). En 2018, il devient champion de Belgique de keirin et de course à l'américaine dans cette catégorie. Il est sélectionné aux championnats d'Europe sur piste juniors de 2018 et décroche l'or sur la course à élimination. Sur route, il est membre de l'équipe nationale et participé à des manches de la Coupe des Nations, sans obtenir de résultat notable.
Après être passé chez les espoirs (moins de 23 ans), Fretin court en 2020 pour l'EFC-L&R Vulsteke, puis en 2021 pour l'équipe Lotto-Soudal Development. Après plusieurs podiums sur l' Okolo Jižních Čech et au Tour de Bretagne, il décroche un contrat avec l'UCI ProTeamSport Vlaanderen-Baloise pour la saison 2022[1],[2]. Il décroche sa première victoire professionnelle au cours de la saison 2023 en remportant la BW Classic, dont c'est la première édition[3].