RSL1D1

RSL1D1 (англ. Ribosomal L1 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 54 973.

RSL1D1
Ідентифікатори
Символи	RSL1D1, CSIG, PBK1, UTP30, L12, ribosomal L1 domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615874 MGI: 1913659 HomoloGene: 41052 GeneCards: RSL1D1
Онтологія гена Молекулярна функція • cadherin binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA 5'-UTR binding Клітинна компонента • ядерце • мембрана • клітинне ядро • cytosolic large ribosomal subunit • 90S preribosome Біологічний процес • regulation of apoptotic process • regulation of cellular senescence • osteoblast differentiation • regulation of protein localization • Біосинтез білків • maturation of LSU-rRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26156	66409
Ensembl	ENSG00000171490	ENSMUSG00000005846
UniProt	O76021	Q8BVY0
RefSeq (мРНК)	NM_015659	NM_025546
RefSeq (білок)	NP_056474	NP_079822
Локус (UCSC)	Хр. 16: 11.83 – 11.85 Mb	Хр. 16: 11.01 – 11.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDSASASLS		SAAATGTSTS		TPAAPTARKQ		LDKEQVRKAV		DALLTHCKSR
KNNYGLLLNE		NESLFLMVVL		WKIPSKELRV		RLTLPHSIRS		DSEDICLFTK
DEPNSTPEKT		EQFYRKLLNK		HGIKTVSQII		SLQTLKKEYK		SYEAKLRLLS
SFDFFLTDAR		IRRLLPSLIG		RHFYQRKKVP		VSVNLLSKNL		SREINDCIGG
TVLNISKSGS		CSAIRIGHVG		MQIEHIIENI		VAVTKGLSEK		LPEKWESVKL
LFVKTEKSAA		LPIFSSFVSN		WDEATKRSLL		NKKKKEARRK		RRERNFEKQK
ERKKKRQQAR		KTASVLSKDD		VAPESGDTTV		KKPESKKEQT		PEHGKKKRGR
GKAQVKATNE		SEDEIPQLVP		IGKKTPANEK		VEIQKHATGK		KSPAKSPNPS
TPRGKKRKAL		PASETPKAAE		SETPGKSPEK		KPKIKEEAVK		EKSPSLGKKD
ARQTPKKPEA		KFFTTPSKSV		RKASHTPKKW		PKKPKVPQST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Huch G., Hohn H.-P., Denker H.-W. (1998). Identification of differentially expressed genes in human trophoblast cells by DDRT-PCR. Placenta. 19: 557—567. PMID 9859858 DOI:10.1016/S0143-4004(98)90015-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 16