El torneo sufrió dos variaciones relacionadas con los clubes participantes: Tras haberse disputado la primera jornada, entraron en competencia la Academia de Fútbol Guanare (Antes llamada EF Seguridad Ciudadana) y Lanceros de Zamora FC, ambos en el Grupo Occidental II. Luego de disputadas cuatro fechas, el CF Bejuma desistió de participar por problemas relacionados con fichajes.
El formato será el mismo usado en la temporada anterior. La temporada se dividirá en dos torneos. El primer lapso será un clasificatorio al Torneo de Promoción y Permanencia que define diez equipos a la Segunda División 2014-15; y el segundo torneo será para definir los restantes equipos que formarán parte de la Tercera División 2014-15
El Torneo Apertura se disputará en un sistema de grupos. Los 37 equipos se dividieron en 7 grupos de acuerdo a su proximidad geográfica. Cada grupo se desarrollará siguiendo un sistema de liga. El orden de los encuentros se decidió por sorteo antes de empezar la competición. Al final del torneo, clasificarán los 2 primeros lugares de los grupos de 6 equipos: Grupo Oriental, Grupo Occidental I, Grupo Central I y Grupo Central II; y el mejor tercer ubicado. Cabe acotar que el Grupo Central III quedó con 5 equipos. Y los grupos con 4 equipos: Grupo Occidental II y Occidental III, avanzarán los primeros lugares, más el mejor segundo lugar. De esta forma, se totaliza 14 clasificados al Torneo de Promoción y Permanencia 2014.
El Monagas SC B no participará en la temporada 2013-14
Intercambios entre la Tercera División y los Torneos Regionales
No existe precisamente un sistema de ascensos y descensos. Los equipos logran retener la categoría en el Torneo Clausura de Tercera División, pero no todos logran cumplir para el siguiente torneo con los compromisos económicos exigidos por la FVF, por lo que se invitan a equipos que cumplan con dichos requisitos, y así completar el cupo.
* Victorianos FC fue descalificado del Torneo de Promoción y Permanencia 2014 debido a las incomparecencias de sus categorías sub-18 y sub-20 en la Serie Interregional.
Juegos intregrupales entre los grupos Occidental 2 y Occidental 3 para equilibrar los partidos disputados, con respecto a los otros grupos. Disputados entre las fechas 4 y 7.
SOC
SCA
UAA
UAZ
Academia Guanare
1-3
--
0-1
--
Atlético Turén
1-1
--
2-0
--
Lanceros de Zamora
--
3-0
--
2-2
Potros de Barinas
--
2-0
--
0-1
AGU
TUR
LAN
POT
Atlético Socopó
--
--
1-1
2-2
FA San Camilo
1-2
0-2
--
--
UA Alto Apure
--
--
2-1
0-0
UA Zamora
6-1
4-1
--
--
En zona de clasificación al Torneo de Promoción y Permanencia 2014
En zona de clasificación como mejor tercero/segundo al Torneo de Promoción y Permanencia 2014
El Torneo arrancó el 8 de marzo de 2014, con los equipos que no pudieron clasificar al Torneo de Promoción y Permanencia. Su objetivo fue definir el resto de equipos participantes para la siguiente temporada.
Varios equipos participantes del Torneo Clasificatorio 2013 decidieron dimitir de su participación en este torneo. En su lugar, equipos de torneos regionales fueron invitados a participar, con previo cumplimiento de requisitos exigidos por la FVF.
Provenientes de los Torneos Estadales
Estudiantes de Aragua CF
Petroleros de Anzoátegui FC
Sucre FC
Orinoco SC
Fundación Unión Deportiva Cultural-Cristiana (UDC)
Atlético Bolívar
Yaddiel Sport de Guasipati FC
Hermandad Gallega de Venezuela (Caracas)
UCV FC
Atlético Libertador FC
Cojedes FC
Semilleros FC
Talentos Carabobo FC
REDI Colón
Soto Rosa FC
CF Gilberto Amaya
Judinense FC
Policía del Táchira FC
Talentos Táchira FC
En cursiva, los equipos que debutan en los torneos federados